スラム街に住む老夫婦が、バイオテックプラントRIVERに仕事に行く。RIVERのシステムエラーで巨大なツリー型装置から「擬似生命誕生装置MOMO」を受け取る。家に帰りMOMOからパーツを抜き取ろうと分解すると、中からMOMO太郎が発見される。MOMO太郎を培養液につけて観察すると人型になってきたので様々な手術を施して最強のサイバー戦士に作り替える。ある日、中央ネットワークからハックによりミッションを急に受け取ったMOMO太郎は、老婦人の住むスラムを脱出する。ミッションとは地球の果てにあると言われている世界を支配する企業「ONIコーポ」を破壊すること。旅を続けるMOMOが砂漠のマーケットのバーで飲んでいると、幽閉されたSARU姫に会う。激闘の末、姫を救い出し一緒に旅をすることになる。その際にKIBI D5　のチップでONIコーポの侵入プログラムを姫にアップグレードする。旅の途中の高知の渓谷でキャンプをしていると3mはあるミュータントKIJIに出会う。KIJIの話では、砂漠にある軍のキャンプの研究所にドローン型戦略兵器INUがあり、それがあるとONIコーポを攻撃できると知る。KIJIと姫と一緒に軍のキャンプに向かい、中央格納庫での戦闘の末にINUを確保、機動に成功してそのままONIコーポへ向かう。ONIコーポに向かう一行。ONIコーポはONIコーポ誕生100周年の祭りを行なっていた。人混みに紛れて中央タワーに辿り着き、潜入する。エレベーターシャフトでKIJIとINUが合体、KIJINUになる。そこにKIBI D5をインストールして第二形態になり臨戦体制が整う。最終決戦のONIのCEOとの決戦。姫はハッキングで後方支援、KIJINUはバーサーく状態で暴れ回る。MOMOが最後にONIの心臓に戦術核兵器INUのコアをセット、核爆弾を爆発させて勝利する。ONIが倒された情報がすぐに月面基地のA-ONIの元へ行く、A-ONIの戦闘兵たちが月面軌道エレベーターに乗り込むために整列する・・・。

俺たちの戦いはここから始まる。